Análisis estructural y biofísico de proteínas que unen lípidos
en parásitos helmintos


Grupo de trabajo

Franchini, Gisela Raquel
Investigadora responsable de línea
gfranchini@gmail.com

Córsico, Betina
Investigadora
bcorsico@med.unlp.edu.ar
Bélgamo, Julián A.  
Becario
belgamojulian@gmail.com
Giorello, Alejandra N. 
Becaria
nahiligiorello@gmail.com
Rodríguez, Santiago  
Pasante
Lombardo, José  
Pasante
Lang, Daiana
Tesinista
   


Colaboradores de otras instituciones

Internacionales

Estévez, Adriana.
Sección Bioquímica, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay.

Ferreira, Ana M.
Cátedra de Inmunología, Facultad de Ciencias/Facultad de Química, Universidad de la República (UdelaR), Montevideo, Uruguay.

Ferreyra, Henrique
Centro de Biotecnología and Departamento de Biología Molecular e Biotecnología, Universidad Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Brasil.

Kennedy, Malcolm W.
Institute of Molecular, Cell and Systems Biology, Glasgow University, Glasgow, Escocia.

Smith, Brian O. 
Institute of Molecular, Cell and Systems Biology, Glasgow University, Glasgow, Escocia.

Zaha, Arnaldo. 
Centro de Biotecnología and Departamento de Biología Molecular e Biotecnología, Universidad Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Brasil. 


Nacionales

Costabel, Marcelo

Grupo de Biofísica, Departamento de Física, Universidad Nacional del Sur (UNS), Bahía Blanca, Argentina.


Radman, Nilda

Cátedra de Parasitología Comparada, Facultad de Cs. Veterinarias, UNLP, La Plata, Argentina.

Rosenzvit, Mara 

Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM), Facultad de Medicina, (UBA-CONICET), Buenos Aires, Argentina.


Resumen de Línea

Los parásitos helmintos producen y secretan una gran variedad de proteínas que unen lípidos (LBPs, del inglés lipid binding proteins) que son estructuralmente distintas de las LBPs presentes en sus respectivos hospedadores. Los cestodes y nematodes parásitos presentan ciertas limitaciones en su metabolismo lipídico, y en algunos casos carecen de las rutas de síntesis de ácidos grasos y esteroles, dependiendo entonces del suministro de estos nutrientes desde sus hospedadores. Si bien no se conoce con exactitud las funciones de las LBPs de parásitos, se postula que estas proteínas podrían estar involucradas en la captación y transporte de los lípidos desde el hospedador. Asimismo, se ha propuesto que las LBPs podrían intervenir en la regulación de la respuesta inmune del hospedador mediante el secuestro de moléculas de señalización. 
Los objetivos generales de este proyecto se centran en la exploración estructural y biofísica de estas proteínas específicas de parásitos potencialmente involucradas en la supervivencia de dichos organismos. Conocer más acerca de las estructuras de estas proteínas, así como de sus interacciones con ligandos y membranas, es de fundamental importancia para intentar comprender las interacciones parásito-hospedador que ellas pudieran mediar. Por otra parte, dichos estudios, permitirán profundizar en el conocimiento de los mecanismos de infección helmíntica y el papel que estas proteínas juegan en la biología de los helmintos en general. Asimismo, esta información podría contribuir al establecimiento de medidas terapéuticas y de prevención de las enfermedades causadas por estos parásitos.
Actualmente estamos trabajando con cuatro tipos importantes de LBP de parásitos de importancia global y local (Ascaris summ, A. lumbricoides, Necator americanus, Echinococcus granulosus): 

a) Proteínas que unen ácidos grasos y retinol (FAR) con una estructura que no tiene homología conocida presentes exclusivamente en nematodes; 

b) Poliproteínas alergénicas de nematodes (NPAs), también exclusivas de nematodes se expresan como como precursores de alto peso molecular conteniendo unidades repetitivas en tándem. Estas unidades son clivadas postraduccionalmente en múltiples entidades proteicas de aproximadamente 15 kDa;

c) Proteínas relacionadas a las proteínas que unen de ácidos grasos (FABPs) de vertebrados, presentes en cestodes y algunas con modificaciones estructurales únicas para nematodes; 

d) Antígeno B, miembro de una nueva familia de proteínas que unen ligandos hidrofóbicos (HLBPs) presentes exclusivamente en cestodos.

Publicaciones - Artículos

  • Diversity in the structures and ligand-binding sites of nematode fatty acid and retinol-binding proteins revealed by Na-FAR-1 from Necator americanus.
    Rey, M. F; Ibañez Shimabukuro, M; Gabrielsen, M; Franchini, G. R; Aj, R; Griffiths, K; Zhan, B; Cooper, A; Kennedy, M. W; Córsico, B; Smith, B. O.
    2015.
    Biochemical Journal, Londres: PORTLAND PRESS LTD, vol. 471, p. 403-414. ISSN 0264-6021


  • Lipid-free antigen B subunits from Echinococcus granulosus: oligomerization, ligand binding, and membrane interaction properties. 
    Silva-Álvarez, V; Franchini, G. R; Pórfido, J. L; Kennedy, M. W; Ferreira, A. M; Córsico, B. 
    2015. PLoS Negl Trop Dis. 9(3): e0003552, doi: 10.1371/journal.pntd.0003552


  • Echinococcus granulosus antigen B: a Hydrophobic Ligand Binding Protein at the host-parasite interface. 
    Silva-Álvarez, V; Folle, A. M; Ramos, A. L; Zamarreño, F; Costabel, M. D; García-Zepeda, E; Salinas, G; Córsico, B; Ferreira, A. M. 
    2015.Prostaglandins Leukot Essent Fatty Acids. 93: 17-23, doi: 10.1016/j.plefa. 2014.09.008


  • Characterization of fatty acid binding and transfer from Δ98Δ, a functional all-β abridged form of IFABP. 
    Rodriguez Sawicki, L; Guerbi, M. X; Falomir Lockhart, L. J; Curto, L; Delfino, J.M; Córsico, B; Franchini, G. R. 
    2014. Biochimica et Biophysica acta-molecular and cell biology of lipids., Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV,. vol. 1841, p. 1733-1740. ISSN 1388-1981

  • IFABP portal region insertion during membrane interaction depends on phospholipid composition.
    De Gerónimo, E; Rodriguez Sawicki, L; Bottasso, N; Franchini, G. R; Zamarreño, F; Costabel, M. D; Córsico, B; Falomir.Lockhart, L. J. 
    2014. Biochimica et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids., Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2014 - . vol. 1841, p. 141-150. ISSN 1388-1981

  • The unusual lipid binding proteins of parasitic helminths and their potential roles in parasitism and as therapeutic targets.
    Franchini, G. R; Porfido, J; Ibañez Shimabukuro, M; Rey Burusco, F; Belgamo, J; Smith, B. O; Kennedy, M. W; Córsico, B.
    2014. Prostaglandins Leukotrienes and Essential Fatty Acids. , Amsterdam: ELSEVIER SCI LTD,. vol. 1841, p. 1733-1740. ISSN 0952-3278


  • Resonance assignment of As-p18, a fatty acid binding protein secreted by developing larvae of the parasitic nematode Ascaris suum. 
    Ibáñez-Shimabukuro, M; Rey-Burusco, M. F; Cooper, A; Kennedy, M. W; Córsico, B; Smith, B. O. 
    2014. Biomol NMR Assign. 8(1): 33-6, 2014. doi: 10.1007/s12104-012-9447-1

  • ¹H, ¹³C and ¹⁵N chemical shift assignments of Na-FAR-1, a helix-rich fatty acid and retinol binding protein of the parasitic nematode Necator americanus
    Rey-Burusco, M. F; Ibañez-Shimabukuro, M; Cooper, A; Kennedy, M. W; Córsico, B; Smith, B. O. 
    2014. Biomol NMR Assign. 8(1): 19-21, doi: 10.1007/s12104-012-9444-4


  • Useable diffraction data from a multiple microdomain-containing crystal of Ascaris suum As-p18 fatty-acid-binding protein using a microfocus beamline. 
    Gabrielsen, M; Riboldi-Tunnicliffe, A; Ibáñez-Shimabukuro, M; Griffiths, K; Roe, A. J; Cooper, A; Smith, B. O; Córsico, B; Kennedy, M. W. 
    2012. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 68(Pt 8): 939-41, doi: 10.1107/S1744309112026553


  • Two crystal forms of a helix-rich fatty acid- and retinol-binding protein, Na-FAR-1, from the parasitic nematode Necator americanus. 
    Gabrielsen, M; Rey-Burusco, M. F; Griffiths, K; Roe, A. J; Cooper, A; Smith, B. O; Kennedy, M. W; Corsico, B. 
    2012. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 68(Pt 7): 835-8, doi: 10.1107/S1744309112023597.
  • Direct interaction between EgFABP1, a fatty acid binding protein fromEchinococcus granulosus, and phospholipid membranes. 
    Porfido, J. L; Alvite, G; Silva, V; Kennedy, M. W; Estevez, A; Corsico, B. 
    2012. PLoS Negl Trop Dis. 6(11): e1893, doi: 10.1371/journal.pntd.0001893

Libros - Capítulos

  • Análisis estructural y funcional de macromoléculas. 
    Córsico, B; Falomir-Lockhart, L. J; Franchini, G. R; Scaglia, N. 
    2013. La Plata. Libro de Catedra. Edulp, p. 422. ISBN 978-950-34-1057-8
  • Microscopía Óptica.
    Falomir Lockhart, L. J; Fuentes, F; Córsico, B; Franchini, G. R; Scaglia, N. 
    2013. Capítulo 13. Microscopía Óptica. La Plata: EDULP, 2013. p. 365-416. ISBN 978-950-34-1057-8
  • Fluorescencia. 
    De Gerónimo, E; Falomir Lockhart, L. J; Córsico, B; Franchini, Gr; Scaglia, N.
    2013. Capítulo 2. Fluorescencia. La Plata: EDULP, 2013. p. 39-77. ISBN 978-950-34-1057-8
  • Interaccion Proteina Proteina. 
    Rodriguez Sawicki, L; Bottasso, N; Córsico, B; Franchini, G; Falomir Lockhart, L. J; Scaglia, N. 
    2013. La Plata: EDULP, 2013. p. 299-342

Premios - Distinciones

  • “Premio mejor trabajo” 
    Academia Nacional de Farmacia y Bioquímica. Jornadas de la Sección Bioquímica de la Academia. Herramientas Modernas para el Estudio de Aspectos Estructurales de Proteínas”. 2009. Structural and biophysical analysis of novel lipid binding proteins from parasitic helminths. 
    Ibañez, M; Rey F; Pórfido, J; Silva, V; Franchini, G. R; Córsico, B.





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